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分子式：C21H20BrN3分子結(jié)構(gòu)
英文名：Ethidium bromide
分子量： 394.3139 g/mol
熔點(diǎn)：260 - 262 °C
為芳香族熒光化合物
EB（Ethidium bromide，溴化乙錠）
溴化乙錠是一種高度靈敏的熒光染色劑，用于觀察瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠中的DNA。溴化乙錠用標(biāo)準(zhǔn)302nm 紫外光透射儀激發(fā)并放射出橙紅色信號(hào)，可用Polaroid 底片或帶CCD 成像頭的凝膠成像處理系統(tǒng)拍攝。
溴化乙錠可以嵌入堿基分子中,導(dǎo)致錯(cuò)配。溴化乙錠是強(qiáng)誘變劑,具有高致癌性! 普通實(shí)驗(yàn)手套（淺黃色乳膠手套）不能很好的阻擋EB，需要用藍(lán)色實(shí)驗(yàn)用手套。
觀察瓊脂糖凝膠中DNA常用的方法是利用熒光染料溴化乙錠進(jìn)行染色，溴化乙錠含有一個(gè)可以嵌入DNA堆積堿基之間的一個(gè)三環(huán)平面基團(tuán)。它與DNA的結(jié)合幾乎沒(méi)有堿基序列特異性。在高離子強(qiáng)度的飽和溶液中，大約每2.5個(gè)堿基插入一個(gè)溴化乙錠分子。當(dāng)染料分子插入后，其平面基團(tuán)與螺旋的軸線(xiàn)垂直并通過(guò)范德華力與上下堿基相互作用。這個(gè)基團(tuán)的固定位置及其與堿基的密切接近，導(dǎo)致與DNA結(jié)合的染料呈現(xiàn)熒光，其熒光產(chǎn)率比游離溶液中染料有所增加。DNA吸收254nm處的紫外輻射并傳遞給染料，而被結(jié)合的染料本身吸收302nm和366nm的光輻射。這兩種情況下，被吸收的能量在可見(jiàn)光譜紅橙區(qū)的590nm處重新發(fā)射出來(lái)。由于溴化乙錠-DNA復(fù)合物的熒光產(chǎn)率比沒(méi)有結(jié)合DNA的染料高出20-30倍，所以當(dāng)凝膠中含有游離的溴化乙錠（0.5ug/ml）時(shí)，可以檢測(cè)到少至10ng的DNA條帶。
溴化乙錠可以用來(lái)檢測(cè)單鏈或雙鏈核酸（DNA或RNA）。但是染料對(duì)單鏈核酸的親和力相對(duì)較小，所以其熒光產(chǎn)率也相對(duì)較低。事實(shí)上，大多數(shù)對(duì)單鏈DNA或RNA染色的熒光時(shí)通過(guò)染料結(jié)合到分子內(nèi)形成較短的鏈內(nèi)螺旋產(chǎn)生的。
由于在該染料存在的情況下，線(xiàn)狀DNA的電泳遷移率約降低15%，因此，當(dāng)需要知道DNA pian段的準(zhǔn)確大小（如DNA限制酶酶切圖譜的鑒定）時(shí)，凝膠應(yīng)該在無(wú)EB情況下電泳，電泳結(jié)束后用EB染色。染色完畢后，通常不需要脫色。但是在檢測(cè)小量DNA（小于10ng）片段時(shí)，通常要將染色后的凝膠進(jìn)行脫色。
溴化乙錠的損害
溴化乙錠可以嵌入堿基分子中，導(dǎo)致錯(cuò)配。溴化乙錠是強(qiáng)誘變劑，具有高致癌性！
SYBR Green I 和溴化乙啶（EB）Ames 測(cè)試結(jié)果顯示EB容易引起有機(jī)體突變。(Singer et al., Mutat. Res. 199, 439: 37- 47.)
溴化乙錠溶液的凈化處理
由于溴化乙錠具有一定的毒性，實(shí)驗(yàn)結(jié)束后，應(yīng)對(duì)含EB的溶液進(jìn)行凈化處理再行棄置，以避免污染環(huán)境和危害人體健康。
(1) 對(duì)于EB含量大于0.5mg/ml的溶液，可如下處理：
①將EB溶液用水稀釋至濃度低于0.5mg/ml；
②加入一倍體積的0.5mol/L KMnO4，混勻，再加入等量的25mol/L HCl，混勻，置室溫?cái)?shù)小時(shí)；
③加入一倍體積的2.5mol/L NaOH，混勻并廢棄。
(2) EB含量小于0.5mg/ml的溶液可如下處理：
① 按1mg/ml的量加入活性炭，不時(shí)輕搖混勻，室溫放置1小時(shí)；
② 用濾紙過(guò)濾并將活性碳與濾紙密封后丟棄。
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